根据相关招生政策和流程，自主招生录取后档案的处理方式如下：
一、自主招生档案不退档
自主招生录取属于高校专项计划， 一旦录取后无法申请退档。考生若对录取结果不满意， 不能参加当年的补录或自主招生，只能选择以下两种途径：
放弃录取：
按原计划参加普通高考，以普通录取结果为准；
转专业或重考：
被录取后可在入学后申请转专业（需符合学校规定）或复读。
二、档案退还流程（针对未被录取情况）
若考生未被自主招生院校录取，档案处理方式如下：
主动申请退档：
需联系录取院校招生办公室，提交退档申请及身份证、准考证等材料；
档案退回：
未被录取后，档案会由高校统一退回省级招生办，考生可拿到纸质档案；
时间限制：
需在收到录取通知书后规定时间内（如开学后10天）办理退档手续，逾期可能视为自动放弃。
三、注意事项
信息更新：
退档后需联系原高中教务处办理档案转出手续，确保档案状态更新；
补录限制：
自主招生档案无法用于其他高校补录，需通过普通高考录取；
转专业政策：
部分高校允许转专业，但需符合学校具体规定，建议提前咨询目标院校。
建议考生在收到录取通知后仔细阅读录取简章中的退档条款，避免因信息误差影响后续升学规划。
