985工程初始有 9所高校，具体信息如下：
初始规模 1999年正式启动的985工程，最初选定清华大学、北京大学等9所高校作为首批建设单位，这些高校被统称为“九校联盟”。
后续扩展
随着工程推进，后续又陆续增加了多所高校，最终形成全国39所985大学的规模。其中，C9联盟高校（包括复旦、上交、南大等）是扩展中的重要组成部分。
命名依据
工程名称“985”源于1998年5月北京大学百年校庆的时间节点。
总结：
985工程从最初9所高校起步，经过多年发展，现涵盖全国39所顶尖高校。
